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門/綱：運動性単細胞の藻類。葉緑体をもたず浸透性または摂食性の従属栄養を営むものもいる。 鞭毛は細胞前端部の消化道から１〜３本出ていて1本は片羽型（１列の側毛）。 中間期の核内で染色体が凝縮したまま。 緑色種は、道管基部付近に眼点をもつ。また、眼点に近接した鞭毛上に感光点（flagellar swelling, paraflagellar body）がある。
ペリクル（細胞表層の膜状外被）はラセン状に走る多数の帯状部（strips）で構成されており、 各々の接着部分が線条（striae）として観察される。
多くは葉緑体が三重膜からなる。クロロフィルa, b、β-カロチン、diadinoxanthin、 diatoxanthin、heteroxanthinなどのキサントフィルを含む。 葉緑体の含有色素は緑藻に似ているが消化道（gullet）など細胞構造が異なる。これらのことからミドリムシの 共生の相手は、緑藻植物 Chlorophyta だと推定されている。
貯蔵物質は主にデンプン類似のパラミロン（β-1,3-グルカン）をもち、 不等毛植物に似ている。 縦分裂で増殖し、有性生殖は知られていない。
多くは自由遊泳性で単体だが、パルメラ状の集落をつくるもの（Colacium）もある。Trachelomonas はロリカとよばれる外殻をもつ。 大部分は淡水性だが、一部海産のものもいる。
目：２本の鞭毛をもつが、１本のみが細胞外へ伸びる。 他は貯胞（reservoir）内にとどまる。 遊泳時，静止時ともに鞭毛全体が動く。 有色と無色の種がいる。ロリカをもつものもいる。１属は群体を形成する。
属：鞭毛は Euglenaと同様。葉緑体は小さく，円盤状。ピレノイドは一般にない。眼点は明瞭。 細胞体は硬く変形しない。扁平で葉状。しばしば ridgeや鰭状の構造をともなう。ねじれているものもいる。 シストはみられない。多くは淡水性。
種： 細胞長80-100μｍ，幅40-45μｍ。 細胞はねじれている。後端部に長い尾状突起がある。葉緑体は円盤状。大きなパラミロン粒が中央部に１個。 鞭毛の長さは細胞体の約半分。(Kudo, 1966)
References
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- 渡邊・堀共訳, 1996, 陸上植物の起源 - 緑藻から緑色植物へ, 内田老鶴圃.
- 堀 輝三編、藻類の生活史集成、１〜３巻、内田老鶴圃、1993
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- 岩波・生物学辞典・第４版, 1996, 岩波書店.
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- Margulis & Schwartz, 1988, Five Kingdoms; An illustrated guide to the phyla of life on earth., Second edition, Freeman and Company.
- Lee, J.J., Hutner, S.H. & Bovee, E.C. (eds.), 1985, An Illustrated Guide to the Protozoa., Society of Protozoologists.
- 猪木正三監修, 1981, 原生動物図鑑, 講談社サイエンティフィク.
- Kudo, R.R., 1966, Protozoology 5th ed., Charles C Thomas Publisher.