 
細胞表層にcortical microtubular ribbonsがある。これにより比較的細胞形態の一定性が保たれている。 鞭毛の軸糸微小管(axonemal microtubules)には paraxial rod と呼ばれるタンパク質の複合体が付随 している。そのため、鞭毛はかなり太くなる。細胞分裂の際に核膜は消失しない。
Metakaryota上門
  ミドリムシ門 Euglenozoa Cavalier-Smith, 1981
    (Hausmann & Hülsmann「Protozoology」2nd ed.)
Subdivisions
Metakaryota上門
 Metakaryota
| ミドリムシ亜門 Euglenida | ミドリムシ綱 Euglenoidea | ユートレプティア目 Eutreptiales Eutreptia, Distigma, Eutreptiella | 
| ミドリムシ目 Euglenales Euglena, Khawkinea, Astasia, Trachelomonas, Colacium, Phacus | ||
| ラブドモナス目 Rhabdomonadales Rhabdomonas, Rhabdospira, Menoidium | ||
| スフェノモナス目 Sphenomonadales Sphenomonas, Petalomonas, Notosolenus, Anisonema | ||
| ヘテロネマ目 Heteronematales Heteronema, Peranema, Entosiphon | ||
| ユーグレナモルファ目 Euglenamorphales Euglenamorpha | ||
| Hemimastigophorea綱 | Hemimastix, Spironema | |
| キネトプラスト亜門 Kinetoplasta | ボド綱 Bodonea | Bodo (ボドヒゲムシ), Rhynchomomas, Ichtyobodo, Cryptobia (=Trypanoplasma), Procryptobia, Cephalothamnium, Dimastigella | 
| トリパノソーマ綱 Trypanosomatidea | Leptomonas, Herpetomonas, Phytomonas, Blastocrithidia, Rhynchoidomomas, Endotrypanum, Crithidia, Leishmania, Trypanosoma (ネズミマクムシ;トリパノゾーマ), Cercobodo | |
| Pseudociliata亜門 Pseudociliata | Stepahnopogon属のみ | |
References