光合成の進化が契機となり、生物界は昔ながらの生活を営む嫌気性の古細菌、 資源枯渇に適応した新型タイプの真正細菌（化学合成・光合成細菌を含む）、 そして、それらの細菌類を食物とする大型細胞の真核生物、という３つのタイプに分化した。
この後、真核細胞は、その食作用を通じて（もしくは細菌類のより積極的なアプローチであ る寄生によって）、真正細菌類を細胞内に共存させる共生進化への道を歩み始める。